Cuando usamos las conjunciones y, oy ni, la coma es opcional, aunque generalmente no la usamos. Pero, por ejemplo, sería recomendable usar la coma en una enumeración de este tipo: No quiero que vengas a por mí, ni que me lleves al cine, ni muchísimo menos que me presentes a tus padres.
No se pone cuando detrás de pero va una pregunta: Pero ¿qué me cuentas?
A veces el hablante necesita confirmar que el receptor escucha y entiende lo que se le dice. En esos casos usamos apéndices confirmativos, que se deben escribir entre comas: No vas a salir, ¿no? / Creías que me iba a ir, ¿no?
En lo que respecta a los números:
La RAE establece que no se puede usar punto ni coma en la parte entera de las cifras: 6000 / 76 000.
Aunque si hablamos de años o del número del DNI, quitaremos los espacios: Año 13500 / DNI 20256895k.
Los puntos suspensivos son solo tres y detrás no llevan nunca punto, ni final ni seguido ni aparte.